iddoweiner/Coding-Sequence-optimization-for-Chlamydomonas-reinhardtii

Version 2.0.0.0 (3,4 Mo) par Iddo Weiner
Coding Sequence optimization for Chlamydomonas reinhardtii
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92 téléchargements
Mise à jour 30 mars 2018
Afficher la licence sur GitHub

This program provides an implementation for carrying out the sequence optimization described in:
'Enhancing Heterologous Expression in C. reinhardtii by Transcript Sequence Optimization'
Weiner et al., The Plant Journal, 2018
This is a standalone application for optimizing DNA sequences meant for achieving high expression in Chlamydomonas reinhardtii (the MATLAB source code is available too).
The fascinating Chlamydomonas picture used as this app's logo was taken by Gerd Guenther:
(https://www.allposters.com/-st/Gerd-Guenther-Posters_c180530_.htm)

Citation pour cette source

Iddo Weiner (2025). iddoweiner/Coding-Sequence-optimization-for-Chlamydomonas-reinhardtii (https://github.com/iddoweiner/Coding-Sequence-optimization-for-Chlamydomonas-reinhardtii), GitHub. Extrait(e) le .

Compatibilité avec les versions de MATLAB
Créé avec R2015a
Compatible avec toutes les versions
Plateformes compatibles
Windows macOS Linux
Catégories
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Version Publié le Notes de version
2.0.0.0

We improved the GUI
I added an .exe file for installing a GUI that conveniently runs our optimization algorithm "behind the scenes" and returns the optimized sequence.
This file is located in the linked Github repository.
highlighted the availability of the source code
Find both source code and a GUI to run it in the linked Github repository
We also added the MATLAB source code for the convenience of MATLAB users
1.0.0.0

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