subSeqs = getSubsequence(object,subset,positions)
returns the partial sequences subSeqs for sequence positions
specified by positions from only object elements specified by
subset.
Retrieve the first five positions of those sequences.
seqs3 = getSubsequence(br,[1 3 5],[1:5])
seqs3 = 3×1 cell
{'CACTA'}
{'AGTGG'}
{'GCTCA'}
You can use a header to get the corresponding sequences with that header. If multiple sequences have the same header, the function returns all of those sequences.
Get the first five positions of the sequences with the header B7_591:4:96:693:509.
Object containing the read data, specified as a BioRead or BioMap object.
Example: bioreadObj
Subset of elements in the object, specified as a vector of positive integers, logical vector,
string vector, or cell array of character vectors containing valid sequence
headers.
Example: [1 3]
Tip
When you use a sequence header (or a cell array of headers) for subset, a
repeated header specifies all elements with that header.
Sequence positions, specified as a vector of positive integers or logical
vector. The last position must be within the range of positions for each
sequence specified by subset.
You clicked a link that corresponds to this MATLAB command:
Run the command by entering it in the MATLAB Command Window.
Web browsers do not support MATLAB commands.
Sélectionner un site web
Choisissez un site web pour accéder au contenu traduit dans votre langue (lorsqu'il est disponible) et voir les événements et les offres locales. D’après votre position, nous vous recommandons de sélectionner la région suivante : .
Vous pouvez également sélectionner un site web dans la liste suivante :
Comment optimiser les performances du site
Pour optimiser les performances du site, sélectionnez la région Chine (en chinois ou en anglais). Les sites de MathWorks pour les autres pays ne sont pas optimisés pour les visites provenant de votre région.