ファイルに入っているtifファイルをまとめてグレースケールとして保存するやり方が分かりません
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thuru
le 15 Jan 2017
Réponse apportée : Tohru Kikawada
le 20 Jan 2017
下記のようにSeries1というファイルに入ったtifファイルをまとめて読み込んだのですが、これらをグレースケールにするやり方が分かりません。rgb2gray関数を使用したのですがエラーがでしまいます。
fileFolder = fullfile(pwd,'Series1'); % 画像の読込み (67枚の断面画像)
files = dir(fullfile(fileFolder,'*.tif'));
fileNames = {files.name};
info = imfinfo(fullfile(fileFolder,fileNames{1}));
numImages = length(fileNames);
tif = zeros(info. Width, info.Height, numImages, 'uint16');
for i=length(fileNames):-1:1
fname = fullfile(fileFolder,fileNames{i});
tif(:,:,i) = uint16(imread(fname));
end
imtool close all;
D = reshape(uint16(tif), [size(tif,1), size(tif,2), 1, size(tif,3)]);
figure; montage(D,'DisplayRange',[]); % D は、128x128x1x15 の配列(x1は、グレースケールの為)
4 commentaires
Tohru Kikawada
le 18 Jan 2017
一番はじめのコードに rgb2gray が見当たりませんが、 rgb2gray によるグレイスケール変換も含めたすべてのコードを提示いただくことは可能でしょうか。
Réponse acceptée
Tohru Kikawada
le 20 Jan 2017
ちょっと状況が飲み込めていませんが、読み込む際にグレイスケールに変換したいのであれば下記の方法で実現できると思います。
ご参考になれば幸いです。
fileFolder = fullfile(pwd,'Series1'); % 画像の読込み (67枚の断面画像)
files = dir(fullfile(fileFolder,'*.tif'));
fileNames = {files.name};
info = imfinfo(fullfile(fileFolder,fileNames{1}));
numImages = length(fileNames);
tif = zeros(info.Width, info.Height, numImages, 'uint16');
for i=length(fileNames):-1:1
fname = fullfile(fileFolder,fileNames{i});
tif(:,:,i) = rgb2gray(uint16(imread(fname)));
end
imtool close all;
D = reshape(uint16(tif), [size(tif,1), size(tif,2), 1, size(tif,3)]);
figure; montage(D,'DisplayRange',[]); % D は、128x128x1x15 の配列(x1は、グレースケールの為)
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