SimBiology

 

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Modéliser, simuler et analyser des systèmes biologiques

Créer des modèles QSP, PBPK et PK/PD

Créez des modèles comme vous les dessineriez sur une feuille de papier dans SimBiology Model Builder ou importez des modèles SBML existants. Utilisez les objets dose et variant pour appliquer des stratégies de dosage (10:00) et stocker des valeurs de quantité alternatives.

Simuler le comportement d'un modèle

Effectuez des simulations avec divers solveurs déterministes et stochastiques en utilisant SimBiology Model Analyzer ou des outils de programmation. La conversion automatique des unités permet d'intégrer toutes les quantités au sein d'un système d'unités cohérent. Générez des rapports à partir des analyses.

Ajuster les données pour estimer les paramètres

Estimez les paramètres en utilisant la régression non linéaire avec des méthodes locales, globales ou hybrides. Calculez les intervalles de confiance des paramètres et des prédictions. Tenez compte des effets fixes et aléatoires avec la modélisation NLME.

Réaliser des simulations de Monte Carlo

Réalisez des scans de paramètres et des simulations de Monte Carlo pour évaluer le comportement du modèle dans différentes conditions et régimes posologiques. Utilisez des curseurs interactifs pour explorer l'impact des variations de quantité sur la réponse du modèle.

Analyses de la sensibilité locale et globale

Découvrez les effets des variations dans les quantités du modèle sur la réponse du modèle en effectuant une analyse de la sensibilité. SimBiology supporte les analyses globales, les analyses de Monte Carlo et les analyses locales basées sur les dérivés.

Analyse non compartimentale

Calculez les paramètres pharmacocinétiques à partir de l'évolution temporelle des concentrations de médicaments sans partir de l'hypothèse d'un modèle compartimental. Réalisez une analyse NCA à la fois sur des données expérimentales et des données de simulation pour des schémas de dosage simple ou multiple.

Accélérer les simulations

Accélérez les grands modèles ou les simulations de Monte Carlo en les convertissant en code C compilé. Améliorez davantage les performances en distribuant les calculs sur plusieurs cœurs, clusters ou ressources cloud avec Parallel Computing Toolbox.

Partager des modèles sous forme d’applications web

Créez des applications dans App Designer, packagez-les avec MATLAB Compiler, puis hébergez-les en utilisant MATLAB Web App Server. Les collaborateurs peuvent accéder aux applications et les exécuter dans un navigateur sans installer de software.

Outils de la communauté

Utilisez SimBiology de manière programmatique avec des scripts MATLAB pour personnaliser et automatiser vos analyses. Les outils fournis par la communauté peuvent être utilisés comme compléments pour l'analyse de modèles, notamment les simulations de populations virtuelles.

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Votre établissement propose peut-être déjà un accès à MATLAB, Simulink et d'autres produits complémentaires via la licence Campus-Wide.