dendrogram関数の配色を任意のものにする

dendrogram関数で作成した系統樹をクラスター毎に色分けするにあたって、自身で指定した配色にしたいのですが、どうすればいいのでしょうか。

今回使用するコードは以下の通りです。

load fisheriris

orgcolor = colororder('default'); % 配色の決定(この配色をクラスターに使用)
Z = linkage(meas,'average','chebychev'); % 階層クラスターツリーの作成
cutoff = median([Z(end-2,3) Z(end-1,3)]); % クラスターを3つに分けれるよう中間点でカット
dendrogram(Z,'ColorThreshold',cutoff) % 系統樹を作成

Answer 1

[Dyuman Joshi]

dendrogram is basically a group of lines. Thus, you will have to change the color of each lines accordingly -

load fisheriris

%orgcolor = colororder('default'); % 配色の決定(この配色をクラスターに使用)
Z = linkage(meas,'average','chebychev'); % 階層クラスターツリーの作成
cutoff = median([Z(end-2,3) Z(end-1,3)]); % クラスターを3つに分けれるよう中間点でカット

%% Original Figure
figure
dendrogram(Z,'ColorThreshold',cutoff); % 系統樹を作成

%% Modified Figure
figure
d = dendrogram(Z,'ColorThreshold',cutoff); % 系統樹を作成
Col = vertcat(d.Color);
[or, ~, idx] = unique(Col, 'rows')

or = 4×3

0 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0

idx = 29×1

3 4 4 4 3 4 4 4 2 3

%define new colors
newcolors = hsv(4)

newcolors = 4×3

1.0000 0 0 0.5000 1.0000 0 0 1.0000 1.0000 0.5000 0 1.0000

%Change the corresponding colors
for k = 1:size(or, 1)
    arr = idx==k;
    set(d(arr), 'Color', newcolors(k, :))
end

[早恵香]

Thank you for your answer. I'll try using the method above.