Chimie

Découverte de molécules avec MATLAB et Simulink

MATLAB propose un environnement robuste pour la découverte de molécules et la chimie computationnelle. Vous pouvez importer, visualiser et analyser des structures chimiques et des jeux de données en utilisant des outils avancés de chimio-informatique, d'intelligence artificielle (IA) et de chimie quantique. L'interopérabilité avec Python® vous permet d'intégrer RDKit, Psi4, VASP, LAMMPS et d'autres bibliothèques pour créer des workflows complets pour le développement de médicaments, la prédiction des propriétés, les simulations moléculaires et l'analyse de la structure électronique.

Avec MATLAB et Simulink, vous pouvez : 

  • Importer, visualiser et partitionner de grands jeux de données moléculaires (SDF, SMILES, CSV, etc.) 
  • Calculer les empreintes moléculaires et effectuer des analyses de similarité grâce à des workflows utilisant MATLAB et RDKit 
  • Exploiter l'accélération GPU pour le clustering et les calculs de similarité à grande échelle 
  • Intégrer des calculs de chimie quantique (DFT, dynamique moléculaire et propriétés électroniques) en utilisant des outils tiers
  • Automatiser les workflows et combiner la chimio-informatique, l'IA et la chimie computationnelle pour la recherche
  • Partager des scripts reproductibles et des applications interactives pour les collaborations et l'enseignement
Nuage de mots-clés présentant des termes liés aux techniques et outils essentiels pour la chimio-informatique, les relations structure-propriété et la chimie computationnelle.

Chimio-informatique avec MATLAB et RDKit

Importez, visualisez et partitionnez des jeux de données moléculaires dans MATLAB pour rationaliser vos workflows de chimio-informatique en utilisant MATLAB avec RDKit.

Diagramme de dispersion d'une base de données partitionnée en fonction des valeurs normalisées LogP et LogS.
Comparaison de la densité électronique radiale de l'hélium estimée avec les méthodes M-SPARC et KSSOLVE (les valeurs énergétiques sont indiquées dans le cadre).

Théorie de la fonctionnelle de la densité

Améliorez votre enseignement de la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) avec MATLAB. Accédez à des outils prêts à l'emploi pour les démonstrations, les calculs quantiques et les visualisations interactives.

Workflow de simulation de dynamique moléculaire MATLAB et Psi4

Exécutez des simulations de dynamique moléculaire et de chimie quantique avec Psi4 dans MATLAB, ce qui vous donnera un moyen accessible d'explorer les workflows de chimie computationnelle.

Structure cristalline du SiO2.

VASPLAB pour MATLAB

Analysez et visualisez les résultats des simulations VASP pour la chimie computationnelle en utilisant VASPLAB (toolbox communautaire) pour MATLAB.

Modèle pharmacocinétique physiologique (PBPK) de l'ensemble du corps

Modélisez et simulez la pharmacocinétique PBPK de l'ensemble du corps avec SimBiology.

Schéma d'un modèle PBPK de l'ensemble du corps illustrant la distribution d'un médicament dans les principaux organes et tissus.

Produits

Découvrez les produits utilisés pour les applications de découverte de molécules.