measurePSF

Version 2.0.0.0 (1,25 Mo) par Rob Campbell
Measure a point spread function and other parameters on a microscope
0.0
(0)
488 téléchargements
Mise à jour 8 sept. 2022
Afficher la licence sur GitHub

This function measures the full-width-half-max of a microscope point spread function (PSF) along both x and y at the z-plane with the brightest intensity, and also along z/x and z/y. The user simply needs to provide a z-stack containing a PSF (e.g. by imaging a sub-micron fluorescent bead) and also the number of microns per pixel along x/y and z. If using ScanImage (2-photon scanning software) the number of microns per pixel are automatically extracted from the TIFF header.

This submission also contains code and information to measure the number of microns per pixel using an EM grid. If using ScanImage, there is a button in the GUI to apply the measured calibration to ScanImage.

Citation pour cette source

Rob Campbell (2024). measurePSF (https://github.com/SWC-Advanced-Microscopy/measurePSF), GitHub. Récupéré le .

Compatibilité avec les versions de MATLAB
Créé avec R2019a
Compatible avec toutes les versions
Plateformes compatibles
Windows macOS Linux
Catégories
En savoir plus sur Biomedical Imaging dans Help Center et MATLAB Answers

Community Treasure Hunt

Find the treasures in MATLAB Central and discover how the community can help you!

Start Hunting!

code

code/+mpsf/+plot

code/+mpsf/+record

code/+mpsf/+report

code/+mpsf/+tools

code/+mpsf/+yaml

code/+mpsf/+yaml/Tests

code/+mpsf/+yaml/extras

code/+mpsf/+yaml/private

code/+sibridge

code/@Grid2MicsPerPixel

code/@measurePSF

Les versions qui utilisent la branche GitHub par défaut ne peuvent pas être téléchargées

Version Publié le Notes de version
2.0.0.0

Update what the submission does.

1.0.0.0

Pour consulter ou signaler des problèmes liés à ce module complémentaire GitHub, accédez au dépôt GitHub.
Pour consulter ou signaler des problèmes liés à ce module complémentaire GitHub, accédez au dépôt GitHub.