Fichiers HDF5

Hierarchical Data Format version 5

Hierarchical Data Format version 5 (HDF5) désigne un modèle de données, une bibliothèque et un format de fichier permettant de stocker et de gérer des données. Il existe plusieurs façons d’interagir avec des fichiers HDF5 :

L’application Import Tool (dans MATLAB^® Online™) et la tâche Import Data du Live Editor offrent des interfaces graphiques intuitives pour explorer et lire des données depuis des fichiers HDF5.
Les fonctions MATLAB HDF5 de haut niveau offrent une interface de programmation simplifiée pour la lecture de données à partir de fichiers HDF5 et l՚écriture de données depuis l՚espace de travail MATLAB vers des fichiers HDF5.
Les fonctions MATLAB HDF5 de bas niveau permettent de mieux contrôler le processus de lecture et d’écriture des fichiers HDF5 en proposant un accès à plus de 300 fonctions dans la librairie C HDF5.
L’utilisation des fonctions MATLAB HDF5 de bas niveau nécessite une bonne connaissance des concepts de programmation de l’API C HDF5, lesquels sont décrits sur https://www.hdfgroup.org/solutions/hdf5/.

MATLAB utilise la librairie C HDF5 version 1.10.11.

Tâches du Live Editor

Import Data

Import data from a file in the Live Editor (depuis R2023a)

Applications

Import Tool

Import data from file

Fonctions

développer tout

Fonctions de haut niveau pour les fichiers HDF5

`h5create`	Create HDF5 dataset
`h5disp`	Display contents of HDF5 file
`h5info`	Information about HDF5 file
`h5read`	Read data from HDF5 dataset
`h5readatt`	Read attribute from HDF5 file
`h5write`	Write data to HDF5 dataset
`h5writeatt`	Write attribute to HDF5 file

Fonctions de bas niveau pour les fichiers HDF5

`Library (H5)`	General-purpose functions for use with entire HDF5 library
`Attribute (H5A)`	Metadata associated with datasets or groups
`Dataset (H5D)`	Multidimensional arrays of data elements and supporting metadata
`Dimension Scale (H5DS)`	Dimension scale associated with dataset dimensions
`Error (H5E)`	Error handling
`File (H5F)`	HDF5 file access
`Group (H5G)`	Organization of objects in file
`Identifier (H5I)`	HDF5 object identifiers
`Link (H5L)`	Links in HDF5 file
`MATLAB (H5ML)`	MATLAB utility functions not part of the HDF5 C library
`Object (H5O)`	Objects in file
`Property (H5P)`	Object property lists
`Reference (H5R)`	HDF5 references
`Dataspace (H5S)`	Dimensionality of dataset
`Datatype (H5T)`	Datatype of elements in a dataset
`Filters and Compression (H5Z)`	Inline data filters, data compression

Rubriques

Import HDF5 Files
Read data from an HDF5 file using the high-level functions, the low-level functions, and the Import Data Live Editor task.
Export to HDF5 Files
Write data and metadata from the MATLAB workspace to an HDF5 file.
Work with Non-ASCII Characters in HDF5 Files
MATLAB supports non-ASCII data and metadata in HDF5 files.
Read and Write Data Concurrently Using Single-Writer/Multiple-Reader (SWMR)
Write data to an HDF5 file in one process while you concurrently read from the file in one or more reader processes.
Work with HDF5 Virtual Datasets (VDS)
Access data stored across multiple HDF5 files as a single, unified HDF5 dataset.
Read and Write HDF5 Datasets Using Dynamically Loaded Filters
The HDF5 library and file format enables using filters on data chunks before they are written to or after they are read from disk.

Informations connexes

Documentation sur la librairie C HDF5